Первый надвратный храм монастыря (по-видимому, деревянный) освящен в 1685 году. В 1694 году на Святых вратах новой каменной ограды по проекту выдающегося русского зодчего Якова Бухвостова было начато сооружение многоярусной Входоиерусалимской церкви, освященной в мае 1697 года.